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医疗品种目录管理系统是指对医疗机构使用的药品、医疗器械和诊疗项目等进行管理和分类的系统，其中包括了药品清单、医疗器械清单、诊疗项目清单等。该系统通过规范和优化医疗品种目录，可以提高医疗服务质量，降低医疗成本，保障医疗安全，切实落实基本医保、特殊疾病保险、医疗救助等政策。同时，该系统也是医保管理的重要手段之一，有利于提升医保基金的利用效率。
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